Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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FAM3AP98173 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FAM3AP98173 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FAM3AP98173 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FAM3AP98173 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FAM3AP98173 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FAM3AP98173 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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