Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms