Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms