Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms