Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP3P57721 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms