Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPAP53621 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPAP53621 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPAP53621 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPAP53621 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPAP53621 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPAP53621 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPAP53621 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms