Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms