Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms