Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NESP48681 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NESP48681 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NESP48681 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NESP48681 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NESP48681 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms