Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms