Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms