Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDH1P40925 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms