Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms