Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJC1P36383 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms