Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms