Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCAP28676 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCAP28676 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCAP28676 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCAP28676 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCAP28676 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms