Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms