Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PLNP26678 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms