Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms