Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms