Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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