Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGFR4P22455 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms