Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms