Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPN3P20807 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms