Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB3P14651 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms