Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms