Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms