Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DMDP11532 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DMDP11532 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DMDP11532 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DMDP11532 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DMDP11532 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DMDP11532 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DMDP11532 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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