Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHGAP10645 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHGAP10645 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms