Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms