Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms