Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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