Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms