Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POP4O95707 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POP4O95707 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POP4O95707 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POP4O95707 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POP4O95707 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POP4O95707 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POP4O95707 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms