Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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