Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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