Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXTL3O43909 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms