Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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