Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9YO00507 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.7 ms