Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms