Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms