Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms