Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms