Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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