Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms