Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms