Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms