Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms