Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
XCL2Q9UBD3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms