Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3BQ9P1U1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3BQ9P1U1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms